Фонд научно-справочной библиотеки Национального архив Республики Карелия насчитывает на сегодняшний день более 29000 единиц хранения.

Наибольшую ценность научно-справочной библиотеки представляют книги дореволюционного периода. Среди них уникальное собрание особо ценных книг - отечественных старопечатных изданий гражданского шрифта на русском языке 1722 - 1830 гг. В основном, книги были получены из различных дореволюционных учреждений, организаций и обществ г. Петрозаводска, а также из частных книжных собраний. На ряде книг присутствуют владельческие штампы Петрозаводского кафедрального собора, библиотеки Олонецкого Александро-Свирского братства в г. Петрозаводске, а также владельческие надписи Олонецкого губернского правления, Петрозаводского городового магистрата, Петрозаводского Петропавловского собора, библиотеки народного училища и др.

В комплекс особо ценных книг входят прижизненные издания архимандрита Амвросия (А.А. Орнатского), Н.М. Карамзина, Н.Я. Озерецковского, И.И. Фольбигера, И.И. Голикова, П.А. Алексеева, Я.В. Орлова, Екатерины II и др.
Самое раннее издание в комплексе особо ценных книг – часть первая «Регламента о управлении Адмиралтейства и Верфи и о должностях Коллегии Адмиралтейской и протчих всех чинов при Адмиралтействе обретающихся»1 (СПб., 1722).

Для краеведов большой интерес представляет «Описание Петрозаводского и Кончезерского заводов, и производимого при оных литья пушек и снарядов», составленное членом Государственной Берг-Коллегии статским советником Иваном Германом (СПБ., 1803). Книга повествует об истории постройки и перестройки заводов, содержит подробное описание заводов, оборудования и всех производственных процессов, начиная с добычи руды. В издании указан весь штат Петрозаводского и Кончезерского заводов на 1800 год с указанием жалованья – поименный список чиновников и список мастеровых. Книга содержит тридцать два рисунка с подробными планами заводов, чертежами машин и печей.

В собрании книг досоветского периода хранятся многотомные издания: более шестидесяти томов «Полного собрания законов Российской империи», изданных с 1830 по 1916 гг.; более двадцати томов «Указов всепресветлейшия державнейшия великая государыни императрицы Екатерины Алексеевны самодержицы всероссийской», изданных в последней четверти XVIII века; около двухсот томов «Горного журнала или собрания сведений о горном и соляном деле, с присовокуплением новых открытий по наукам, к сему предмету относящимся», изданных с 1825 по 1916 гг.; более сотни томов «Собрания узаконений и распоряжений правительства», изданных в последней четверти XIX начале XX веков; более шестидесяти томов «Энциклопедического словаря» Ф.А. Брокгауза и И.А. Ефрона, изданных  с 1890 по 1904 гг.

Среди книг и периодики досоветского периода следует выделить ряд изданий, пользующихся повышенным спросом у исследователей-краеведов: одно из самых полных собраний «Памятных книжек Олонецкой губернии», а также газет «Олонецкие губернские ведомости» и «Олонецкие епархиальные ведомости»; второй и третий выпуски издания «Олонецкий сборник. Материалы для истории, географии, статистики и этнографии Олонецкого края»; «Списки населенных мест Олонецкой губернии» по сведениям за 1873, 1892, 1905 гг.; «Обзоры Олонецкой губернии»; «Известия Общества изучения Олонецкой губернии».

Популярны также очерки и исследования об Олонецком крае, его истории, монастырях, фольклоре и промыслах таких авторов, как Н.С. Шайжин, Д.П. Ягодкин, М. Правдин, А.П. Воронов, Е.В. Барсов, И. Благовещенский, Д.В. Островский, А. Иванов, М.А. Круковский и многие другие.

Кроме «Олонецких губернских ведомостей» и «Олонецких епархиальных ведомостей» в фонде НСБ имеются и другие периодические издания досоветского периода, как центральные («Сенатские ведомости», «Вестник правительства», «Церковные ведомости», «Отечественные записки», «Русская старина», «Русский вестник», «Русское богатство», «Вестник Европы», «Былое», «Живая старина» и др.), так и губернские - «Олонецкая неделя», «Олонецкий край», «Олонецкое утро», «Олонецкое эхо».

Большой массив изданий досоветского периода отражает деятельность земства Олонецкой губернии: «Вестник Олонецкого губернского земства», «Журналы Олонецкого губернского земского собрания», «Доклады Олонецкой губернской земской управы губернскому земскому собранию», «Сборники постановлений Олонецкого губернского земского собрания», «Отчеты Олонецкой губернской земской управы», «Отчеты Петрозаводской уездной управы», журналы уездных земских собраний, очерки деятельности земства за определенные периоды и др.

Среди книг советского периода немало литературы, долгие годы находившейся на секретном хранении, недоступной для исследователей и рассекреченной в полном объеме лишь в 1988-1990 гг. Преимущественно это политические и историко-политические сочинения 1917- начала 1930-х гг. таких партийный деятелей, как Г.В. Зиновьев, Л.Д. Троцкий, Н.И. Бухарин, А.И. Рыков, М. Томский, Н.Н. Попов, Е.М. Ярославский, историк М.Н. Покровский и др. Среди книг советского периода немало характерных для политической эпохи 1930-х гг. изданий: «Троцкисты и зиновьевцы враги народа: «Сборник материалов» (Л., 1936), Доклад и Заключительное слово на пленуме ЦК ВКП(б) 3-5 марта 1937 г. И.В. Сталина «О недостатках партийной работы и мерах ликвидации троцкистских и иных двурушников» (Л., 1937) и т. д.

Фонд советского периода хранит самую первую в истории Карелии Конституцию 1937 г. - Конституция (Основной Закон) Карельской Автономной Советской Социалистической Республики и издание Конституции Карелии 1938 г. на карельском языке.

Для краеведов представляет интерес первый в истории справочник г. Петрозаводска  «Весь Петрозаводск: справочная книга г. Петрозаводска на 1923 год с приложением плана города».
Из современных изданий можно отметить книги «Реформа и реформаторы» (2012 г.), «Жизнь замечательных петрозаводчан. Сборник рассказов и воспоминаний ветеранов» (2011 г.), «Документы и материалы по истории кижского архитектурного ансамбля (1694-1945) (2013 г.), «Книги кириллической печати в хранилищах Республики Карелия (1569-1830). Каталог. (2013 г.), «Каргапольское путешествие. Семь маршрутов по северно-русской земле с Каргопольским историко-архитектурным и художественным музеем. (2014 г.) и многие другие.

В фонде НСБ немало изданий, подготовленных Национальным архивом Республики Карелия или составленных на основе документов архива. Среди самых популярных - «Карелия в годы Первой мировой войны: сборник документов и материалов» (2014 г.); «Карелия в Великой Отечественной войне: освобождение от оккупации и возрождение мирной жизни, 1944-1945. Сборник документов и материалов» (2010 г.); буклет «Архивная служба Республики Карелия» (2014 г.). В настоящее время фонд библиотеки комплектуется преимущественно книгами краеведческого характера, большей частью полученными в дар  от исследователей, организаций и учреждений.
В целом, комплекс книг советского и постсоветского периодов содержит как центральные издания - политическая литература советского периода, книги по истории, архивоведению, народному хозяйству, так и республиканские – по культуре, истории, искусству, экономике, статистике, промышленности и сельскому хозяйству Карелии.

Среди газет советского периода есть отдельные центральные издания, но основная часть – республиканские. Одно из самых полных собраний основной республиканской газеты «Красная Карелия» («Известия Олонецкого губернского Совета крестьянских, рабочих и солдатских депутатов», «Олонецкая коммуна», «Коммуна», «Карельская коммуна», «Ленинское знамя», «Ленинская правда»); отдельные подшивки республиканских газет 1920 - 1930-х гг.: «Красная молодежь», «Трудовая жизнь», «Петрозаводская правда», «Карельский связист», «Ударник», «Голос лесоруба» и др.; газеты 1930 - 1940-х гг. - «Сталинская трасса», «Кировская магистраль», «Комсомолец Карелии» («Молодой большевик»), «Онежец»; красноармейские газеты Карельского фронта периода Великой Отечественной войны «На боевом посту», «В бой за родину», «Боевой путь»; многочисленные районные газеты.

Отдельный комплекс представляет собой литература из личных собраний представителей культуры и науки, чьи документы и книги были переданы в Национальный архив Республики Карелия: Я.В. Ругоева, Э. Патлаенко, Г.Н. Синисало, Д.Я. Гусарова, Ю. Линника, В.П. Фартушного, Ю.И. Дюжева, В.В. Мальми и др. Большое количество книг из личных фондов содержат дарственную надпись автора или составителя. Таким образом, книги из личных фондов хранят автографы известных поэтов, писателей, художников, публицистов и ученых ХХ века, как Карелии, так и России – Р. Рождественского, Д.А. Гранина, Я.В. Ругоева, Д.Я. Гусарова, В.А. Потиевского, В.Г. Базанова, А.М. Линевского, Б.А. Шмидта, Ю.В. Линника, А.И. Авдышева, Г.А. Стронка, В. Чекмасова, М.В. Тарасова, Г.Г. Скворцовой, Ю.И. Дюжева, А.И. Титова и многих других.

Отдельный раздел представляет собой литература на финском языке, изданная в Финляндии в XIX - XX веках: многочисленные сборники законов Финляндии, документы сессий парламента, статистические сборники, исследования по истории Финляндии, энциклопедии, словари, государственные календари Финляндии и др. Среди самых ранних книг - «Свод законов Финляндии» 1817 года издания. Из современного: «Изучение рутовых солдат (исследование). Вуоримиес Х.; «Опись (списки) бракосочетавшихся (венчавшихся) в приходе Акаа 1810-1830» Группа специалистов по генеалогии г. Акаа; «Словарь для специалиста (исследователя) генеалогии. Вяйно Сойнтула и многое др.